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中科院、首都醫科大新成果單分子測序的甲基化組分析
更新時間：2015-12-31 點擊次數：1073次日前，在Nucleic acid research雜志上，由中科院、首都醫科大等機構的研究人員對MTBC進行了深入研究。他們發現，單分子實時測序可以實現的甲基化組分析。這項研究說明，SMRT平臺在甲基化組分析上很有潛力，能顯著增強我們對DNA MTase功能的了解。
肺結核(TB)是結核分枝桿菌復合群(MTBC)造成的常見傳染病。現有抗生素能夠緩解肺結核的癥狀，但治療往往持續數月而且還無法將其**，導致這種疾病在治療數年后頻頻復發。
中科院、首都醫科大等機構的研究人員對MTBC進行了深入研究。他們發現，單分子實時測序可以實現的甲基化組分析。這項研究發表在前不久的Nucleic acid research雜志上，文章的通訊作者是中科院北京基因組研究所的陳非和首都醫科大學附屬北京胸科醫院的黃海榮。
為了全面了解MTBC的基因組甲基化，研究人員采用PacBio的單分子實時測序技術(SMRT)完成了12個MTBC菌株的基因組，并且分析了它們甲基化組的特征。研究人員鑒定了三個m6A序列模體及其相應的甲基轉移酶(MTase)基因，包括已知的mamA、hsdM和新發現的mamB。他們還通過實驗驗證了HsdM和MamB的甲基化模體和功能。
研究顯示，上述12種菌的MTase活性并不相同。單分子測序可以揭示每個修飾位點的甲基化狀態，得出特定MTBC菌株的甲基化組。未修飾的位點大多與轉錄因子的結合區域重疊，這可能為這些位點提供了保護，使其不被甲基化。
