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影響western blot實(shí)驗(yàn)的幾個(gè)因素

更新時(shí)間:2022-04-20   點(diǎn)擊次數(shù):1621次

影響western blot實(shí)驗(yàn)的幾個(gè)因素

Western Blot實(shí)驗(yàn)又稱蛋白質(zhì)印跡法(免疫印跡試驗(yàn)),它是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的一種實(shí)驗(yàn)方法。其基本原理是通過特異性抗體對凝膠電泳處理過的細(xì)胞或生物組織樣品進(jìn)行著色。通過分析著色的位置和著色深度獲得特定蛋白質(zhì)在所分析的細(xì)胞或組織中表達(dá)情況的信息。

Western blotting是一個(gè)步驟繁多的實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)中的每一步都會對最后的結(jié)果產(chǎn)生影響,下面將為你總結(jié)一些影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的因素:

1. 樣品質(zhì)量

所抽取樣品的蛋白含量,蛋白變性是否充分等等,還有,蛋白樣品的PH值是否在7~8之間。這會直接影響到樣品濃縮的效果。此外,蛋白樣品是否降解、目的蛋白是否已抽取充分都會對最終結(jié)果的可靠性有影響。

2.凝膠質(zhì)量

不連續(xù)SDS-PAGE膠對凝膠的要求較高,具體的影響因素有:(1)分離膠的PH值應(yīng)在8.8左右,而濃縮膠的PH應(yīng)在6.8左右,最好不要差過0.5個(gè)PH單位,因?yàn)檫@個(gè)PH條件是保證電泳液中的不電離的必要條件,也是保證能充分壓縮樣品的前提。因此,制備凝膠的時(shí)候所用Tris-HCl緩沖液的PH值是否穩(wěn)定是很重要的。(2)用丙烯酰胺的純度和凝膠聚合時(shí)間,不純的丙烯酰胺會含有丙烯酸,它會影響到凝膠內(nèi)部局部PH環(huán)境,因此會影響電泳的效果,沒有聚合充分的凝膠會含有游離的丙烯酰胺,也會影響到局部PH環(huán)境,它們還會與蛋白上的氨基、巰基以及酚羥基反應(yīng)影響蛋白的泳動。凝膠聚合時(shí)間以分離膠>45min,濃縮膠>20min為宜。此外,單體放置時(shí)間過長也會造成丙烯酸的累積。(3)凝膠母液混合是否均勻也會影響到凝膠濃度的分布。(4)配備的母液中丙烯酰胺和甲叉丙烯酰胺的比例也會影響到網(wǎng)孔的大小,因此也會對電泳的質(zhì)量有影響。(5)APS及TEMED的加入量,APS極易潮解而失去活性,因此最好是現(xiàn)用現(xiàn)配,APS不宜加入過多,否則會氧化蛋白樣品。(6)點(diǎn)樣孔底部要平整。

3. 點(diǎn)樣

樣品盡量不要與電泳液混合,這樣能提高濃縮的效果,因?yàn)殡娪疽篜H值為8.3,而樣品為7.5,混合后會影響到樣品的PH值,進(jìn)而影響濃縮效果。因此,建議點(diǎn)樣最好用長qiang頭,或者加樣器,輕輕的將樣品加到孔的底部。還有,加樣之前最好先沖洗一下加樣孔底部,減少沒有聚合的丙烯酰胺的影響。盡量從加樣孔的中間點(diǎn)樣,這樣能使得樣品在加樣孔中的濃度分布盡量均勻,這也會對最終蛋白條帶的形狀有影響的。加樣量也不能過高或過低,過高會影響條帶的形狀,過低不利于后面的雜交反應(yīng)。

4. 電泳緩沖液

盡量用新鮮配制的。這樣能保證PH值和離子強(qiáng)度的穩(wěn)定。

影響western blot實(shí)驗(yàn)的幾個(gè)因素

 

 

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